Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CEP290O15078 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CEP290O15078 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CEP290O15078 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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CEP290O15078 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CEP290O15078 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CEP290O15078 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CEP290O15078 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CEP290O15078 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CEP290O15078 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CEP290O15078 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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