Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 CSMD1-202ENST00000400186 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 CSMD1-217ENST00000602723 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms