Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ALCAMQ13740 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms