Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms