Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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