Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms