Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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CASQ1P31415 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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CASQ1P31415 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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CASQ1P31415 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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