Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NMBRP28336 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NMBRP28336 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NMBRP28336 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms