Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms