Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms