Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms