Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms