Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms