Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms