Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
INO80Q9ULG1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
INO80Q9ULG1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms