Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PARP4Q9UKK3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms