Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms