Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFT172Q9UG01 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms