Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CFDP1Q9UEE9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFDP1Q9UEE9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFDP1Q9UEE9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms