Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DKK3Q9UBP4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK3Q9UBP4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms