Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC40.04■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC39.94■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC39.94■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.99
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms