Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms