Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms