Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms