Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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