Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ASF1BQ9NVP2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms