Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms