Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FZD3Q9NPG1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms