Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms