Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXF3Q9H4D5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXF3Q9H4D5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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