Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6BQ9H3T3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6BQ9H3T3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms