Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms