Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms