Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDCA7Q9BWT1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA7Q9BWT1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms