Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C2orf88Q9BSF0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms