Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms