Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms