Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIGSQ96S52 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIGSQ96S52 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms