Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms