Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms