Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms