Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms