Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms