Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms