Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms