Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC97Q96F63 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC97Q96F63 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC97Q96F63 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC97Q96F63 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC97Q96F63 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC97Q96F63 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC97Q96F63 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC97Q96F63 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC97Q96F63 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC97Q96F63 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms