Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms