Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMPDL3BQ92485 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms