Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms