Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00116Q8NCU8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms